في يوم السبت 16/6/2012 حوالي السادسة مساء انطلقت مظاهرة من داخليات جامعة الخرطوم (البركس) حيث تظاهرت الطالبات ضد الزيادة المؤلمة لأسعار الوجبات وتعرفة المواصلات. وصلت مظاهرة الطالبات إلى داخلية الطلاب وتضامن معهم طلاب داخليات جامعة الخرطوم (وسط). تواصلت المظاهرة حتى وصلت شارع الجمهورية وجاءت قوات الشرطة وفرقت الطلاب. بعد عودة الطالبات إلى البركس خرجن مرة أخرى إلى الشارع وتوالت مضايقات قوات الشرطة وجهاز الأمن وطلاب المؤتمر الوطني الذين جاؤوا حاملين السيخ والعصى لتهديد الطالبات. واقتحم ضباط الشرطة وجهاز الأمن وطلاب المؤتمر الوطني ساحة داخليات البنات وأغرقوها بالبمبان وعرضوا الفتيات لمضايقات شفوية ووصفوهن بأقبح الألفاظ. تواصلت هذه الأحداث حتى الواحدة صباحاَ، وأقام الطلاب مخاطبات في داخليتي الطلاب والطالبات وأكدوا خروجهم إلى الشارع في اليوم التالي.
في صباح يوم الأحد 17/6/2012 تجمع طلاب وطالبات جامعة الخرطوم في كليات الجامعة وابتدروا مخاطبات أعلنوا فيها تفاصيل أحداث الليلة السابقة واقتحام الشرطة لداخليات البنات. تزامن ذلك مع اقتحام الشرطة ولليوم الثاني على التوالي لداخلية البركس وضرب الطالبات بالهروات. فور وصول الخبر للجامعة تجمع الطلاب بأعداد كبيرة في شارع المين داخل الجامعة وتصاعدت الهتافات والشعارات وخرج حشد الطلاب الضخم عبر البوابة وهم يهتفون ضد الغلاء ويطالبون بحقوقهم كطلبة. خرج الطلاب وأغلقوا شارع الجامعة في ظل تفاعل مع المواطنين حتى وصلت الشرطة وقامت بالاعتداء على الطلاب. وتصادم الطلاب مع الشرطة صداماً بطولياً تعالت معه هتافات ضد النظام. وأطلقت الشرطة كميات هائلة من الغاز المسيل للدموع واقتحمت الحرم الجامعي. تواصل الصدام حتى تمكن الطلاب الشرفاء من طرد قوات الشرطة خارج الجامعة.
بعد ذلك قامت قوات الشرطة وجهاز الأمن وطلاب المؤتمر الوطني بالدخول عبر البوابة الشرقية بالبكاسي حاملين السيخ والسواطير وقطع المولتوف وقام الطلاب بمواجهتهم بشجاعة إلى أن لاذوا بالفرار وهربوا إلى مسجد الجامعة حيث كانوا يخزنزن أسلحتهم من السيخ والسواطير. تزامن ذلك مع اعتقال أعداد من الطلاب عبر بكاسي جهاز الأمن من جميع الأنحاء المحاوطة للجامعة بعد أن انهالوا عليهم بالضرب المبرح.
تجمعت قوات الشرطة وجهاز الأمن وطلاب المؤتمر الوطني مجدداً وحاولوا اقتحام الجامعة مرة أخرى لكن تصدي الطلاب البطولي لهم منعهم إلى أن هربوا مرة أخرى.
تزامنت هذه الأحداث داخل سنتر جامعة الخرطوم مع أحداث مشابهة بفروع جامعة الخرطوم الشتى ككلية التربية بأمدرمان وكلية الزراعة بشمبات والداخليات التابعة لها حيث تصادمت قوات الشرطة والأمن مع الطلاب المتظاهرين.
تم اعتقال العديد من الطلبة وإطلاق سراحهم لاحقاً بعد أن انهال عليم ضباط الشرطة بالضرب المبرح. وتم التبليغ عن إصابات عديدة عانى منها الطلاب بعد اشتباكهم مع الشرطة وتعرضهم إلى الغاز الميل للدموع، بالإضافة إلى عناصر من الشرطة أصيبوا من قبل الطلبة الذين تصدوهم.
ظلت قوات الأمن تحاصر داخليات أبو دجانة وبركس الطالبات والوسط حتى مساء الأحد حيث هناك توقعات بأن يتم اقتحامها جميعاً والاعتداء على طلابها العزل.